（1）《直航船舶进出港申请书》（一式四份）——办理两岸直航船舶进港申请时（2）代理公司有效的代理经营资格证书（一次性查验）——办理两岸直航船舶进港申请时（3）有效的《国际船舶保安证书》或《临时国际船舶保安证书》和船舶保安信息材料复印件〔适用客船（包括高速客船）及500总吨及以上的货船〕（必要时）——办理两岸直航船舶进港申请时（4）国际防止油污证书及其附件（格式B）的复印件、CAS检验报告的复印件、所载运油品名称以及15℃时密度、50℃时流动粘度（燃油）的说明文书（必要时）——办理两岸直航船舶进港申请时（5）《油污损害民事责任保险或其他财务保证证书》或《燃油污染损害民事责任保险或其他财务保证证书》复印件（适用时）——办理两岸直航船舶进港申请时（6）专项护航申请（需要时）——办理两岸直航船舶进港申请时（7）经批准的危险货物进港申报单复印件（必要时）——办理两岸直航船舶进港申请时（8）《台湾海峡两岸间水路运输许可证》和《台湾海峡两岸间船舶营运证》复印件（提交后有效期内免于再次提交）——办理两岸直航船舶进港申请时（9）船舶概况报告单（出港时无变更者免）——办理两岸直航船舶进出港手续时（10）船员名单（出港时无变更者免）——办理两岸直航船舶进出港手续时（11）旅客名单（无旅客或出港时无变更者免）——办理两岸直航船舶进出港手续时（12）货物申报单（出港时本港无装货者免）——办理两岸直航船舶进出港手续时（13）上一港口出港许可证明（适用于进港）——办理两岸直航船舶进出港手续时（14）船舶登记证书（首次进本港时提交）——办理两岸直航船舶进出港手续时（15）船舶检验证书（首次进本港时提交）——办理两岸直航船舶进出港手续时（16）船员适任证书（包括其他特殊培训证书）——办理两岸直航船舶进出港手续时（17）《船舶最低安全配员证书》（首次进本港时提交）——办理两岸直航船舶进出港手续时（18）危险货物申报单（适用于装载危险货物的船舶，危险货物实现网上申报的可提交审核回执）——办理两岸直航船舶进出港手续时（19）船舶出港手续联系单（出港时需提交）——办理两岸直航船舶进出港手续时（20）安全监督管理所需要的其他证书——办理两岸直航船舶进出港手续时

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